Les résidents du Sud-Soudan ont la possibilité de poursuivre des études supérieures dans une université ou soit une école professionnelle. Bien qu'il y ait une pénurie de ces deux institutions, plusieurs programmes sont en place pour élargir le paysage actuel de l'enseignement supérieur dans le Sud-Soudan.

Les cours universitaires sont dispensés par des enseignants qualifiés et sont destinés à renforcer les compétences et les connaissances dans un domaine ou un sujet en particulier. La durée, le contenu et le sujet varient en fonction des cours.